Laboratory Manager

Il Quake Laboratory sarà istituito presso l'ETH Zürich nel 2026 da Stephen Quake, che si trasferisce dalla Stanford University. Il laboratorio lavora all'interfaccia tra fisica, ingegneria e biologia, sviluppando nuovi approcci di misurazione e modellazione che trasformano ciò che è possibile apprendere dalle singole cellule e da minime quantità di materiale molecolare. Tre principali programmi di ricerca saranno attivi in parallelo: (1) ricostruire l'architettura regolatoria di E. coli ad alta risoluzione come base per modelli predittivi della regolazione genica; (2) costruire atlanti su larga scala di singole cellule di tessuti umani e di organismi modello — incluso un atlante del sistema nervoso autonomo umano unico nel suo genere — e addestrare modelli AI/foundation su tali atlanti per interrogare la biologia dell'invecchiamento e l'evoluzione della multicellularità; e (3) far progredire gli approcci di biopsia liquida che leggono acidi nucleici cell-free dal sangue per rilevare malattie e monitorare la fisiologia in collaborazione con partner esterni. Il laboratorio sarà un ambiente multidisciplinare di circa 10 persone che comprende biologi molecolari, biochimici, biologi computazionali, ricercatori di machine learning, fisici e ingegneri, con collaborazioni attive con ETH, EPFL, l'Università di Zürich e a livello internazionale. Il Laboratory Manager è la spina dorsale operativa del gruppo. Ti occuperai del funzionamento quotidiano di un complesso wet lab multi-modale — dalla biologia molecolare batterica al processamento di campioni clinici umani, fino al sequenziamento high-throughput — fungendo al contempo da scienziato senior di banco, formatore e consulente fidato del PI su tutto ciò che permette a un gruppo di ricerca produttivo di funzionare. Questo ruolo è ideale per un ricercatore esperto che ama lavorare su molteplici sistemi biologici, costruire infrastrutture, fare da mentore a colleghi meno esperti e trarre soddisfazione dall'eccellenza operativa. Non ti sarà richiesto di guidare un programma di ricerca indipendente separato; piuttosto, abiliterai e accelererai quello di tutti gli altri. In cambio, sarai un contributore fondamentale e nominato in una scienza ambiziosa, con una voce autentica su come il laboratorio viene costruito. Operazioni di laboratorio e infrastruttura Guidare la realizzazione e la gestione continua delle strutture wet-bench del laboratorio presso l'ETH, inclusa la selezione delle attrezzature, l'installazione, la qualificazione e i contratti di manutenzione ordinaria Stabilire e mantenere risorse condivise: sale per la coltura cellulare, aree BSL-2, zone di preparazione per il sequenziamento, stoccaggio a –80 °C e azoto liquido, autoclavi, scorte comuni di reagenti e calendari degli strumenti Gestire gli ordini, le relazioni con i fornitori, la gestione dell'inventario e l'organizzazione del magazzino per consumabili e reagenti; negoziare accordi quadro dove utile Mantenere e sottoporre ad audit le SOP principali, i sistemi di tracciamento dei campioni e le pratiche del quaderno di laboratorio elettronico in tutto il gruppo Agire come interfaccia del laboratorio con le strutture core dell'ETH (ad es., Functional Genomics Center Zurich, ScopeM, Genome Engineering & Measurement Lab) e fornitori di servizi esterni Biologia molecolare batterica e biochimica — reguloma di E. coli Gestire e supervisionare un pipeline di clonaggio molecolare per E. coli — progettazione e assemblaggio di plasmidi e costrutti integrati nel genoma, costruzione di ceppi e conservazione Impostare e mantenere flussi di lavoro biochimici rilevanti per gli studi regolatori: espressione e purificazione proteica, trascrizione in vitro e biochimica quantitativa a seconda delle necessità dei progetti Stabilire l'infrastruttura per la crescita microbica, l'induzione e il time-course, inclusi lettori di piastre, sistemi di coltura continua e interfacce microfluidiche dove pertinente Formare i nuovi membri del laboratorio in microbiologia fondamentale, tecniche sterili e genetica standard di E. coli; risolvere problemi in progetti di clonaggio ed espressione bloccati Biologia cellulare di mammifero e gestione dei tessuti — atlanti a singola cellula Gestire e supervisionare la coltura cellulare di mammifero (cellule primarie, cellule derivate da iPSC, linee stabilite), inclusa la preparazione dei terreni, l'autenticazione delle linee e il biobanking Stabilire flussi di lavoro robusti per la dissociazione dei tessuti, la preparazione di sospensioni di singole cellule e singoli nuclei, il sorting cellulare basato su FACS e la valutazione della qualità Coordinare il pipeline di acquisizione dei tessuti con partner clinici e accademici — accordi sui biospecimen, documentazione della catena di custodia, logistica di fissazione e spedizione, gestione dei campioni approvata dall'etica Flussi di lavoro di biopsia liquida e acidi nucleici cell-free Gestire e mantenere flussi di lavoro di estrazione di cfDNA e cfRNA a basso input Implementare e perfezionare i protocolli di preparazione delle librerie cfNA (WGS a piccolo input, metilazione/EM-seq, frammentomica, pannelli mirati, cfRNA-seq) e contribuire allo sviluppo di metodi per nuove modalità di saggio Stabilire pratiche di gestione della qualità appropriate per campioni di grado clinico Sequenziamento high-throughput Agire come esperto senior del laboratorio per i flussi di lavoro di sequenziamento — inclusi QC della libreria, pooling, bilanciamento e funzionamento degli strumenti o coordinamento con i fornitori Stabilire dashboard di QC e criteri di accettazione per diversi tipi di librerie (bulk RNA-seq, single-cell RNA/ATAC, spaziale, cfDNA/cfRNA, microbico) Coordinarsi con i membri del team computazionale per sample sheets, demultiplexing, QC primario e restituzione tempestiva di FASTQs e metriche standard Mantenere relazioni con il Functional Genomics Center Zurich e fornitori di sequenziamento esterni per gestire eccessi di la