Laboratory Manager

Das Quake Laboratory wird im Jahr 2026 an der ETH Zürich von Stephen Quake gegründet, der von der Stanford University wechselt. Das Labor arbeitet an der Schnittstelle von Physik, Ingenieurwesen und Biologie und entwickelt neue Mess- und Modellierungsansätze, die verändern, was man aus einzelnen Zellen und aus winzigen Mengen an molekularem Material lernen kann. Es werden drei große Forschungsprogramme parallel laufen: (1) die Rekonstruktion der regulatorischen Architektur von E. coli mit hoher Auflösung als Grundlage für prädiktive Modelle der Genregulation; (2) der Aufbau groß angelegter Single-Cell-Atlanten von menschlichem Gewebe und Modellorganismen – einschließlich eines weltweit einzigartigen Atlas des menschlichen autonomen Nervensystems – und das Training von KI/Foundation-Modellen auf diesen Atlanten, um die Biologie des Alterns und die Evolution der Vielzelligkeit zu untersuchen; und (3) die Weiterentwicklung von Liquid-Biopsy-Ansätzen, die zellfreie Nukleinsäuren aus Blut lesen, um Krankheiten zu erkennen und die Physiologie in Zusammenarbeit mit externen Partnern zu überwachen. Das Labor wird ein multidisziplinäres Umfeld von etwa 10 Personen sein, das Molekularbiologen, Biochemiker, Computerbiologen, Forscher im Bereich Machine Learning, Physiker und Ingenieure umfasst, mit aktiven Kooperationen an der ETH, EPFL, der Universität Zürich und international. Der Laboratory Manager ist das operative Rückgrat der Gruppe. Sie verantworten das tägliche Funktionieren eines komplexen, multimodalen Wet-Labs – von der bakteriellen Molekularbiologie über die Verarbeitung menschlicher klinischer Proben bis hin zum High-Throughput-Sequencing – während Sie gleichzeitig als erfahrener Bench-Scientist, Trainer und vertrauenswürdiger Berater des PI in allen Belangen fungieren, die eine produktive Forschungsgruppe am Laufen halten. Diese Rolle ist ideal für eine erfahrene wissenschaftliche Fachkraft, die gerne über mehrere biologische Systeme hinweg arbeitet, Infrastruktur aufbaut, weniger erfahrene Kollegen mentoriert und Stolz auf operative Exzellenz legt. Es wird nicht von Ihnen erwartet, ein separates, unabhängiges Forschungsprogramm voranzutreiben; vielmehr werden Sie das Programm aller anderen ermöglichen und beschleunigen. Im Gegenzug werden Sie ein zentraler, namentlich genannter Mitwirkender an ehrgeiziger Wissenschaft sein, mit einer echten Stimme bei der Frage, wie das Labor aufgebaut wird. Laborbetrieb und Infrastruktur Leitung des Ausbaus und des laufenden Betriebs der Wet-Bench-Einrichtungen des Labors an der ETH, einschließlich Geräteauswahl, Installation, Qualifizierung und Wartungsverträgen Aufbau und Pflege gemeinsamer Ressourcen: Zellkulturräume, BSL-2-Bereiche, Sequenzierungsvorbereitungszonen, –80 °C- und Flüssigstickstofflagerung, Autoklaven, gemeinsame Reagenzienbestände und Geräte-Kalender Verantwortung für Bestellungen, Lieferantenbeziehungen, Bestandsmanagement und Lagerorganisation für Verbrauchsmaterialien und Reagenzien; Aushandeln von Rahmenvereinbarungen, wo sinnvoll Pflege und Auditierung der Kern-SOPs, Probenverfolgungssysteme und elektronischer Laborbuch-Praktiken in der gesamten Gruppe Dienst als Schnittstelle des Labors zu den ETH Core Facilities (z. B. Functional Genomics Center Zurich, ScopeM, Genome Engineering & Measurement Lab) und externen Dienstleistern Bakterielle Molekularbiologie und Biochemie — E. coli Regulom Durchführung und Überwachung einer molekularen Klonierungs-Pipeline für E. coli — Design und Assemblierung von Plasmiden und genomintegrierten Konstrukten, Stammkonstruktion und Lagerung Aufbau und Pflege biochemischer Arbeitsabläufe, die für regulatorische Studien relevant sind: Proteinexpression und -reinigung, In-vitro-Transkription und quantitative Biochemie, je nach Projektbedarf Aufbau der Infrastruktur für mikrobielles Wachstum, Induktion und Zeitreihen, einschließlich Plate-Readern, kontinuierlichen Kultursystemen und Mikrofluidik-Schnittstellen, wo relevant Einarbeitung neuer Labormitglieder in grundlegende Mikrobiologie, sterile Techniken und Standard-E. coli-Genetik; Fehlerbehebung bei stagnierenden Klonierungs- und Expressionsprojekten Säugetierzellbiologie und Gewebehandhabung — Single-Cell-Atlanten Durchführung und Überwachung der Säugetierzellkultur (Primärzellen, iPSC-abgeleitete Zellen, etablierte Linien), einschließlich Medienherstellung, Linienauthentifizierung und Biobanking Aufbau robuster Arbeitsabläufe für Gewebedissoziation, Single-Cell- und Single-Nucleus-Suspensionsvorbereitung, FACS-basierte Zellsortierung und Qualitätsbewertung Koordination der Gewebeakquisitions-Pipeline mit klinischen und akademischen Partnern — Vereinbarungen über Bioproben, Chain-of-Custody-Dokumentation, Fixierungs- und Versandlogistik, ethisch genehmigte Probenhandhabung Liquid Biopsy und Arbeitsabläufe für zellfreie Nukleinsäuren Betrieb und Wartung von Low-Input cfDNA- und cfRNA-Extraktions-Workflows Implementierung und Verfeinerung von cfNA-Library-Preparation-Protokollen (Small-Input WGS, Methylierung/EM-seq, Fragmentomics, Targeted Panels, cfRNA-seq) und Mitwirkung an der Methodenentwicklung für neue Assay-Modalitäten Einführung von Qualitätsmanagement-Praktiken, die für klinische Proben angemessen sind High-Throughput-Sequencing Dienst als leitender Praktiker des Labors für Sequenzierungs-Workflows — einschließlich Library QC, Pooling, Balancing und Gerätebedienung oder Koordination mit Anbietern Aufbau von QC-Dashboards und Akzeptanzkriterien für verschiedene Library-Typen (Bulk RNA-seq, Single-Cell RNA/ATAC, Spatial, cfDNA/cfRNA, mikrobiell) Koordination mit Mitgliedern des Computational-Teams bezüglich Sample Sheets, Demultiplexing, primärem QC und rechtzeitiger Rückgabe von FASTQs und Standardmetriken Pflege der Beziehungen zum Functional Genomics Center Zurich und zu externen Sequenzierungsanbietern zur Abdeckung von Auslastungsspitzen und Spezialplattformen Personal, Training und Kultur einarbeitung neuer Labormitglied