Postdoc en biologie des systèmes computationnelle et modélisation métabolique

Berne, 100 % *La dysrégulation du métabolisme des lipides joue un rôle clé dans le développement et la progression des troubles métaboliques, y compris l'obésité, le diabète de type 2 et la maladie du foie stéatosique associée à un dysfonctionnement métabolique (MASLD). Nous recherchons un(e) scientifique hautement motivé(e) en biologie computationnelle et des systèmes pour travailler sur un projet financé par la Swiss National Science Foundation (SNSF) visant à faire progresser notre compréhension du métabolisme lipidique humain dans la MASLD. Le projet se concentre sur la modélisation du métabolisme humain en intégrant des données cliniques à des modèles expérimentaux. Il implique des données biochimiques et moléculaires provenant de multiples tissus et biofluides pour étudier le métabolisme spécifique aux tissus, les interactions métaboliques entre les organes, ainsi que l'absorption, la transformation et la libération des nutriments. Le projet combine la modélisation statistique, la biologie des systèmes et la modélisation métabolique in silico avec des données cliniques, transcriptomiques, protéomiques, métabolomiques/lipidomiques, d'imagerie moléculaire spatiale et de flux métaboliques expérimentaux afin de fournir de nouvelles perspectives sur les altérations métaboliques complexes sous-jacentes à la MASLD.* Ce que vous pouvez attendre ## • Développer et appliquer des modèles mathématiques, statistiques et d'apprentissage automatique à des ensembles de données biologiques et cliniques complexes, multidimensionnels et multimodaux, y compris des données spatiales et d'imagerie • Modéliser le métabolisme des lipides et des nutriments en utilisant des approches compartimentales, cinétiques, mécanistes, de réseaux métaboliques ou basées sur la physiologie • Reconstruire et modéliser des réseaux métaboliques spécifiques aux tissus et valider les prédictions des modèles à l'aide de données expérimentales • Participer et contribuer à des projets de recherche multidisciplinaires et collaboratifs. • Préparer, présenter et communiquer les résultats scientifiques lors de réunions internes, de conférences internationales et par le biais de publications évaluées par des pairs Votre profil ## • Doctorat ou équivalent en biologie computationnelle, biologie des systèmes, mathématiques appliquées, génie biochimique ou dans un domaine connexe • Forte expertise en modélisation mathématique et statistique, en apprentissage automatique et en biologie des systèmes, avec une expérience de l'analyse de données biologiques ou cliniques multidimensionnelles, multimodales ou multi-omiques • Expérience démontrée en modélisation métabolique in silico, par exemple la modélisation métabolique basée sur des contraintes ou à l'échelle du génome, la reconstruction de réseaux métaboliques, la modélisation cinétique ou du flux métabolique, ou la simulation basée sur les données • Maîtrise de R, Python ou MATLAB et expérience de l'intégration de données expérimentales avec des modèles computationnels ; • Une expérience en spectrométrie de masse, en omiques spatiales, en imagerie moléculaire ou en imagerie tissulaire est un atout majeur • Scientifique enthousiaste et collaboratif possédant de solides compétences analytiques et de résolution de problèmes, la capacité de travailler de manière indépendante et au sein d'équipes multidisciplinaires, et un excellent niveau d'anglais écrit et parlé Ce que nous offrons ## • Un environnement de recherche de pointe, de soutien et de collaboration, offrant des opportunités de développement scientifique et professionnel • La participation à des projets de recherche multidisciplinaires à l'interface de la biologie computationnelle, de la biologie des systèmes, du métabolisme, de la multi-omique, de l'imagerie moléculaire et de la recherche clinique • L'opportunité de travailler avec de grands ensembles de données provenant d'études précliniques et cliniques • Une collaboration étroite avec des experts de différentes disciplines scientifiques et cliniques ## Location Inselspital, Universitätsspital Organisation Centre for Laboratory Medicine, University Hospital Bern Workload 100 % Start 1 October 2026 or by agreement Reference 19495 Type of Contract Temporary Work Location Inselspital, Universitätsspital Bern Freiburgstrasse, CH-3010 Bern Schweiz