Postdoc in Computational Systems Biology und Metabolic Modeling

Berne, 100 % *Die Dysregulation des Lipidstoffwechsels spielt eine Schlüsselrolle bei der Entstehung und dem Fortschreiten von Stoffwechselstörungen, einschließlich Adipositas, Typ-2-Diabetes und der mit metabolischen Dysfunktionen assoziierten steatotischen Lebererkrankung (MASLD). Wir suchen eine hochmotivierte(n) Scientist in Computational and Systems Biology für ein durch die Swiss National Science Foundation (SNSF) gefördertes Projekt, das darauf abzielt, unser Verständnis des menschlichen Lipidstoffwechsels bei MASLD zu vertiefen. Das Projekt konzentriert sich auf die Modellierung des menschlichen Stoffwechsels durch die Integration klinischer Daten mit experimentellen Modellen. Es umfasst biochemische und molekulare Daten aus mehreren Geweben und Biofluiden, um gewebespezifischen Stoffwechsel, metabolische Interaktionen zwischen Organen sowie die Aufnahme, Umwandlung und Freisetzung von Nährstoffen zu untersuchen. Das Projekt kombiniert statistische Modellierung, Systembiologie und In-silico-Stoffwechselmodellierung mit klinischen, transkriptomischen, proteomischen, metabolomischen/lipidomischen, räumlichen molekularen Bildgebungs- und experimentellen Stoffwechselflussdaten, um neue Einblicke in die komplexen metabolischen Veränderungen zu gewinnen, die MASLD zugrunde liegen.* Was Sie erwarten kann ## • Entwicklung und Anwendung mathematischer, statistischer und Machine-Learning-Modelle auf komplexe, hochdimensionale und multimodale biologische und klinische Datensätze, einschließlich räumlicher und bildgebender Daten • Modellierung des Lipid- und Nährstoffstoffwechsels unter Verwendung von kompartimentellen, kinetischen, mechanistischen, metabolischen Netzwerk- oder physiologisch basierten Ansätzen • Rekonstruktion und Modellierung gewebespezifischer metabolischer Netzwerke und Validierung von Modellvorhersagen anhand experimenteller Daten • Teilnahme an und Mitwirkung an multidisziplinären und kollaborativen Forschungsprojekten • Vorbereitung, Präsentation und Kommunikation wissenschaftlicher Ergebnisse bei internen Besprechungen, internationalen Konferenzen und durch Peer-Review-Publikationen Ihr Profil ## • PhD oder gleichwertig in Computational Biology, Systems Biology, angewandter Mathematik, Biochemical Engineering oder einem verwandten Bereich • Fundierte Expertise in mathematischer und statistischer Modellierung, Machine Learning und Systembiologie, mit Erfahrung in der Analyse hochdimensionaler, multimodaler oder Multi-Omics-biologischer oder klinischer Daten • Nachgewiesene Erfahrung in der In-silico-Stoffwechselmodellierung, z. B. constraint-basierte oder genomweite Stoffwechselmodellierung, Rekonstruktion metabolischer Netzwerke, kinetische oder Stoffwechselflussmodellierung oder datengesteuerte Simulation • Beherrschung von R, Python oder MATLAB und Erfahrung in der Integration experimenteller Daten mit computergestützten Modellen; • Erfahrung in Massenspektrometrie, Spatial Omics, molekularer Bildgebung oder Gewebebildgebung ist ein starkes Plus • Begeisterte(r) und kollaborative(r) Wissenschaftler(in) mit starken analytischen Fähigkeiten und Problemlösungskompetenz, der Fähigkeit, unabhängig und in multidisziplinären Teams zu arbeiten, sowie exzellenten Englischkenntnissen in Wort und Schrift Was wir bieten ## • Ein unterstützendes, kollaboratives und hochmodernes Forschungsumfeld mit Möglichkeiten zur wissenschaftlichen und beruflichen Weiterentwicklung • Teilnahme an multidisziplinären Forschungsprojekten an der Schnittstelle von Computational Biology, Systems Biology, Stoffwechsel, Multi-Omics, molekularer Bildgebung und klinischer Forschung • Die Möglichkeit, mit großen Datensätzen aus präklinischen und klinischen Studien zu arbeiten • Enge Zusammenarbeit mit Experten aus verschiedenen wissenschaftlichen und klinischen Disziplinen ## Location Inselspital, Universitätsspital Organisation Centre for Laboratory Medicine, University Hospital Bern Workload 100 % Start 1 October 2026 oder nach Vereinbarung Reference 19495 Type of Contract Temporary Work Location Inselspital, Universitätsspital Bern Freiburgstrasse, CH-3010 Bern Schweiz