Posizione di postdoc per lo sviluppo di pipeline analitiche e analisi per il rilevamento di specie aliene invasive in sistemi acquatici utilizzando eDNA (2 anni)

• 10 luglio 2026 • 100% • Posizione permanente • Dübendorf Eawag, l'Istituto federale svizzero di scienza e tecnologia acquatica, è un istituto di ricerca acquatica a rete internazionale all'interno del dominio ETH (Istituti federali svizzeri di tecnologia). Eawag svolge attività di ricerca, istruzione e consulenza esperta per raggiungere gli obiettivi duplice di soddisfare le esigenze umane dirette di acqua e mantenere la funzione e l'integrità degli ecosistemi acquatici. Posizione di postdoc per lo sviluppo di pipeline analitiche e analisi per il rilevamento di specie aliene invasive in sistemi acquatici utilizzando eDNA (2 anni) # Il laboratorio Altermatt presso il Dipartimento di ecologia acquatica di Eawag e il Dipartimento di biologia evolutiva e studi ambientali (IEU) dell'Università di Zurigo hanno una vacanza per un Le specie aliene invasive (IAS) sono a livello globale e nazionale un principale driver di perdita di biodiversità. Le IAS possono essere trovate in tutti gli ecosistemi, ma sono particolarmente diffuse e problematiche negli ecosistemi acquatici, poiché la loro gestione e il controllo, una volta stabiliti, sono molto difficili o addirittura impossibili. Di conseguenza, la prevenzione e l'allarme precoce sono essenziali e entrambi dipendono dalla sorveglianza e dal monitoraggio. L'eDNA (acronimo di environmental DNA) sta emergendo come uno strumento adatto per la sorveglianza spaziale e temporale e il riconoscimento precoce e il monitoraggio dell'arrivo e dell'insediamento delle IAS, tuttavia la generalizzazione, la robustezza e l'implementazione sono ancora in fase di sviluppo. Nel quadro di questo progetto di postdoc, si stabiliranno e si svilupperanno pipeline analitiche per analizzare e rilevare le specie aliene invasive utilizzando set di dati eDNA esistenti. La focus iniziale sarà su IAS in Europa centrale/Svizzera, ma le pipeline dovrebbero essere scalabili in tutta Europa e oltre. Le proprie contribuzioni e idee sono esplicitamente incoraggiate e si concede un'amplia libertà intellettuale per plasmare il progetto. Il progetto coinvolge: i) l'istituzione di banche dati di riferimento per analisi di metabarcoding delle IAS (basate sulla letteratura/mining dei dati su più marker/gruppi tassonomici); ii) lo sviluppo di pipeline analitiche semiautomatiche end-to-end per analisi di metabarcoding dell'eDNA con riguardo al monitoraggio e al rilevamento delle IAS, consentendo l'analisi autonoma dei segnali delle IAS nei set di dati di metabarcoding dell'eDNA e fornendo misure di confidenza delle rilevazioni delle IAS; iii) test e applicazione di principio di queste pipeline su set di dati eDNA acquatici esistenti (pesci e invertebrati), basandosi su serie temporali ad alta risoluzione dell'eDNA e 250 siti di monitoraggio di routine in tutta la Svizzera. Il progetto è interamente finanziato e si collega all'iniziativa NRP82 - Smart Monitoring of Swiss Waters (FutureProof) e a una sovvenzione di ricerca dell'Ufficio federale svizzero per l'ambiente (BAFU/FOEN). I risultati del progetto saranno pubblicati su riviste peer-reviewed di primo livello, seguiranno i principi FAIR e daranno anche luogo a strumenti di applicazione pronti all'uso in collaborazione con gli stakeholder. La posizione deve essere occupata da un candidato motivato in grado di assumere un ruolo di leadership nell'analisi dei dati avanzata e nella programmazione, con focus sulla valutazione delle IAS nei sistemi di acqua dolce utilizzando set di dati eDNA. Per candidarsi, è necessario avere un dottorato di ricerca in ecologia molecolare, bioinformatica, biodiversità o scienze dei dati, o un campo di scienza strettamente correlato. È necessario avere precedenti esperienze in bioinformatica e analisi dei dati di metabarcoding dell'eDNA, e conoscenze sull'analisi dei dati di biodiversità/IAS. Si prevede un'esperienza generale nella programmazione e nell'analisi dei dati. Una solida base concettuale in ecologia molecolare/ecologia delle acque dolci e una buona comprensione della teoria ecologica sono un vantaggio. Un interesse dimostrato per la scienza aperta e riproducibile (ad esempio principi FAIR, esperienza con strumenti di versioning) è un vantaggio. La lingua di lavoro nei gruppi è l'inglese. È richiesta la fluenza nella parlata e nella scrittura. Ulteriori competenze linguistiche in tedesco o francese per le interazioni con gli stakeholder sono utili. Il progetto è guidato dal prof. Dr Florian Altermatt presso l'Università di Zurigo e Eawag. Il candidato selezionato sarà basato e assunto nel gruppo del prof. Dr Florian Altermatt (www.altermattlab.ch) presso l'Università di Zurigo e Eawag (Dübendorf, Svizzera). Il progetto consente collaborazioni con stakeholder nazionali/cantonali. La posizione è interamente finanziata per due anni e dovrebbe iniziare nel quarto trimestre del 2026 o nel primo trimestre del 2027. Cerchiamo una persona altamente motivata, entusiasta e indipendente con una passione per la scienza e l'implementazione. Presso Eawag, abbiamo un ambiente di lavoro in cui le persone con diverse esperienze, forze e prospettive possono contribuire appieno e svilupparsi ulteriormente. Qui, puoi aiutarci ad avanzare! Promuoviamo una partecipazione genuina, uno scambio e una comprensione reciproca. Creiamo strutture che consentono la compatibilità del lavoro e di altre aree della vita, come il lavoro di cura, e facciamo costantemente sforzi per ridurre le barriere. Hai requisiti specifici riguardo al processo di candidatura o alla posizione, o hai bisogno di ulteriori informazioni? Parla con noi - saremo felici di supportarti con possibili soluzioni di lavoro flessibile, orari di lavoro e progettazione del lavoro. Per ulteriori informazioni, visita il nostro sito web su Eawag e le nostre condizioni di impiego. Le candidature devono essere presentate entro il 14 agosto 2026. La tua candidatura dovrebbe includere una lettera che descrive i