Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100%

Die Abteilung für Molekulare Pathologie am Departement für Pathologie und Molekulare Pathologie des Universitätsspitals Zürich ist eine führende Einheit für Entwicklungen in der Präzisionsmedizin, einschliesslich Tumorgenomik und Multi-Omics-Datenintegration. Die diagnostischen Analysen umfassen zahlreiche moderne Omics-Methoden und modernste Technologien: Whole genome sequencing, bulk RNA sequencing, methylation array, digital pathology, panel sequencing. Unsere Wissenschaftler analysieren die Rohdaten dieser Assays, um diagnostische Berichte zu erstellen, neue Methoden zu entwickeln und Forschungsprojekte zu unterstützen. Ihre Hauptaufgaben <br /> • Selbstständige Analyse, Qualitätskontrolle und Interpretation von NGS- und Multi-Omics-Daten in einem diagnostischen Umfeld • Entwicklung, Validierung und Implementierung von Bioinformatik-Pipelines für die routinemässige molekulare Diagnostik • Immunogenomische Analysen mit klinisch relevanter Interpretation • Anwendung von Machine Learning / KI-Methoden auf Omics-Daten, mit Schwerpunkt auf Robustheit und Interpretierbarkeit • Translation neuer Methoden in die Routine-Diagnostik, einschliesslich Dokumentation und Validierung • Erstellung klinischer Berichte in Zusammenarbeit mit Pathologen und Molekularbiologen • Unterstützung bei der Schulung von medizinischem und Laborpersonal in der Dateninterpretation und Bioinformatik-Workflows <br /> Ihr Profil <br /> • MSc oder PhD in Bioinformatik, Computational Biology, Medizinische Informatik oder einem verwandten Bereich • Starke Erfahrung in der NGS/Omics-Datenanalyse in einem angewandten Umfeld • Fundierte Kenntnisse in Python und/oder R (Bioconductor) • Starkes Verständnis der Molekularbiologie und Genetik mit der Fähigkeit, Daten in einem biologischen und klinischen Kontext zu interpretieren • Fundiertes Verständnis von Statistik und Machine Learning • Erfahrung mit Workflow-Managementsystemen (Nextflow, Snakemake) und Containerisierung (Docker/Singularity) • Exzellente analytische, kommunikative und schriftliche Fähigkeiten • Englisch erforderlich, Deutsch ist ein Vorteil Bevorzugte Qualifikationen: Erfahrung in Cancer Genomics, Immunogenomics, Transcriptomics oder Epigenetics, Metagenomics, KI-basierter Bildanalyse, Datenmanagement/strukturierter Berichterstattung, integrativer Multi-Omics oder Arbeit in einem klinischen/medizinischen Umfeld <br /> Weitere Informationen Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an Dr. Dr. Bettina Sobottka (annabettina.sobottka-brillout@usz.ch) oder PD Dr. med. Jan Hendrick Rüschoff (JanHendrik.Rueschoff@usz.ch). Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung Daniel Buschor Recruiting Für diese Stelle können keine Dossiers von Personalvermittlern berücksichtigt werden. Danke für Ihr Verständnis. Unsere Benefits benefit1,benefit2,benefit3,benefit4,benefit5,benefit6,benefit7,benefit8 Über das USZ Das Universitätsspital Zürich ist eines der grössten Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden und rund 700 Auszubildende setzen sich täglich für das Wohl unserer Patient:innen ein.